Existuje několik jednotek, které se liší etiologií, dědičností a klinickými projevy.
Klasifikace dle Potterové:
pozn. dysplázii II. a IV. typu dle Potterové mnozí autoři neoddělují jako zvláštní kategorie, ale vnímají je jako různě těžká postižení při téže primární příčině, tj. obstrukci močových cest.
Korové nebo glomerulární mikrocysty zjišťujeme jako vedlejší nález také u řady syndromů a metabolických vad, jde např. trisomie 13, trisomie 18, Zellwegerova syndromu, některých chondrodysplázií. Cystická dysplázie ledvin patří k základní diagnostické trias u autosomálně recesivního Meckelova syndromu (polydaktylie, encefalokéla, polycystické ledviny).