Obecně se jedná buď o stenózu (zúžený průsvit) nebo o atrezii (neprůchodnost, chybějící spojení).

Stenóza a atrézie vedou k hypertrofii srdečních oddílů před stenózou (práce proti zvýšenému odporu) a k městnání před stenózou. Pravostranné obstrukce vedou ke sníženému průtoku plícemi. Levostranné obstrukce vedou ke sníženému systémovému průtoku. Atrezie navíc způsobuje hypoplazii srdečních oddílů za překážkou (nedostatečně vyvinuté srdeční oddíly neexistuje li žádný průtok).

Dysplastické chlopně: další anomálie tvaru a úponu chlopní.

Polyvalvulární dysplázie: dysplázie cípatých i semilunárních chlopní je nalézána v 90% případů trisomie 18, méně často u jiných aneuploidií (např. trisomie 13). Cípy chlopní jsou volné, vlající, myxoidně ztluštělé či nodulární, často též s droboučkými krevními jezírky při okraji cípu. Aortální a pulmonární chlopeň bývají dvoucípé. Nejvíce postiženy jsou obvykle chlopně mitrální a trikuspidální.