Příčiny neimunitního hydropsu jsou roztříděny a s příklady uvedeny níže. Nicméně nejméně ve 20% případů se ani podrobným vyšetřením nepodaří příčinu hydropsu stanovit (tzv. idiopatický hydrops).

1. Hematologické:
   • Homozygotní α thalasemie
   • hemolytické anémie (př. deficit glukosa-6-fosfatázy)
   • fetofetální transfúze dvojčat: chronická fetofetální transfuze dvojčat
   • chronická fetomaternální transfúze: krvácení plodu do cirkulace matky v důsledku porušení integrity v placentární cirkulaci. Někdy je tento stav spojen se zjevným traumatem, ale většinou zůstává příčina nejasná. K diagnostice se využívá testu Kleihauer Betke, který umožňuje detekovat fetální erytrocyty (s obsahem fetální formy hemoglobinu HbF) v krvi matky.
2. Kardiovaskulární:
   • Strukturální srdeční vady, např. hypoplastické levé srdce, Ebsteinova malformace, předčasný uzávěr foramen ovale aj.
   • Cévní malformace s AV shuntem fetální i placentární (rozměrný chorangiom)
   • Nestrukturální srdeční vady
   • Supraventrikulární tachyarytmie plodu —  jsou relativně časté a mají velmi dobrou prognózu
   • Kongenitální AV blokáda  —  komplikuje graviditu žen se systémovým lupusem. Poškození převodního systému fetálního srdce je způsobeno antinukleárními protilátkami, které procházejí placentou
   • Bradykardie při komplexních srdečních malformacích  —  zejména syndromy asplenie/polysplenie, defekt AV septa aj., prognóza je velmi špatná
   • Acardius, viz kapitola Acardius
   • Nádory srdce (rhabdomyom)
3. Infekce:
   • parvovirus B19 Způsobuje až 1/3 neimunních hydropsů. Velmi nakažlivý virus je původcem exantémové dětské choroby tzv. páté dětské nemoci. U hematologicky nemocných vyvolává život ohrožující aplastickou krizi. Virus cíleně napadá prekurzory červených krvinek. Transplacentárně se přenáší na plod a vede k anémii plodu, hydropsu a potratu. Ve tkáních plodu jsou přítomny jaderné erytrocyty s velkými intranukleárními eozinofilními inkluzemi. V diagnostice se využívá PCR. Virus není teratogenní.
   • adnátní syfilis
   • infekce TORCH
4. Metabolické vady: existuje velmi rozsáhlý výčet metabolických vad spojovaných s hydropsem; ze známějších uvádíme Gaucherovu chorobu.
5. Chromozomální aberace:
   • Turnerův syndrom, viz kapitolu o Turnerovu syndromu
   • Trisomie
6. Tumory a pseudotumory dutiny hrudní a břišní:
   • cystická adenomatoidní malformace plic viz CCAM kazuistika
   • atrezie trachey/laryngu
   • brániční hernie
   • polycystické ledviny
   • kongenitální nádory (neuroblastom aj)
7. Genetická onemocnění:
   • chondrodysplázie
   • letální syndrom mnohočetných pterygií
   • tuberózní skleróza
8. Různé:
   • kongenitální nefrotický syndrom
   • atrezie a duplikace GIT
   • obstrukce dolních močových cest