V atlase existuje řada typů obrázků: snímky pacientů, snímky z pitevny, snímky biopsií, klinické obrazy (endoskop), rtg snímky různých metodik (CT, angiografie, MR) a dále snímky histologické (běžné metody, fluorescence, polarizace, FISH a další).

Na většině obrazů je možné si aktivovat šipky, které směřují na důležité oblasti obrazů.

Některé makroskopické snímky a většinu snímků histologických je možné zvětšit. Zvětšeným obrazem pak lze pohybovat tažením myší.

Některé snímky z CT nebo MR obsahují více obrazových rovnin, mezi kterými je možné přecházet. Šipky se však vztahují pouze k rovině výchozí. Podobným způsobem jsou sestaveny i některé snímky angiografické, kde je možné procházet jednotlivými snímky časové řady a sledovat tak například průběh nástřiku.

Některé histologické snímky je možné ostřit jako u mikroskopu (byly nasnímány ve více rovinách, mezi rovinami lze přecházet).

Většina histologických snímků byla nasnímána ve velkém rozlišení. Uživatel si může aktivovat lupu (malé okno), jejíž obsah se řídí cvakáním myší na základní obraz.

Některé snímky (kde originál je obraz o hraně až desítek tisíc obrazových bodů) je možné zobrazit prohlížečem na bazi FLASH readeru (který musí být nainstalovaný). Prohlížeč zoomify (www.zoomify.org) umožňuje zoomování obrazu až do plného rozlišení a pohyb v obraze tažením myší.

Nejnovější řešení přístupu k obrazovému detailu je na bazi čistého JavaScriptu, takže nevyžaduje instalaci žádných přídatných softwarových modulů. Uživatel má k dispozici okno virtuálního mikroskopu. Je možné měnit zvětšení a u snímků pořízených ve více rovinách lze i fokusovat. Okno je možné libovolně zvětšit (až na celou obrazovku), tažením myší pohybovat obrazem, škálou vlevo nahoře měnit zvětšení a (pokud je fokusování k dispozici) škálou vlevo dole nebo kolečkem myši měnit obrazové roviny.