Atlas patologie kostní dřeně: Hardware

+ Úvod

+ Jak používat tento atlas

+ Podmínky používání atlasu

+ Co je třeba k užívání tohoto atlasu

+ Technické informace o přípravě atlasu

+ Hardware

+ Software

+ Návod k používání a ovládání atlasu

+ Pohyb mezi stránkami atlasu

+ Ovládání obrázků

+ Virtuální mikroskop

+ Obrázková loga

+ Problémy

+ Netscape

+ Microsoft Internet Explorer

+ Demonstrace některých obrazů

+ Některé Internetové zdroje týkající se dermatopatologie a patologie

+ Podpora atlasu

+ Patologie kostní dřeně

+ Vyšetření kostní dřeně

+ Histologické vyšetření trepanobioptického válečku

+ Normální kostní dřeň

+ Celularita kostní dřeně

+ Hematopoeza

+ Nenádorové afekce kostní dřeně

+ Reaktivní změny hematopoézy

+ Hyperplazie erytropoezy

+ Hyperplazie myelopoezy

+ Eozinofilie

+ Zmnožení megakaryocytů

+ Hypoplazie a aplazie kostní dřeně

+ Aplastická anémie

+ Čistá aplazie červených krvinek (pure red cell aplasia)

+ Agranulocytóza

+ Amegakaryocytární trombocytopenie

+ Anémie

+ Posthemoragické anémie

+ Akutní posthemoragická anémie

+ Chronická posthemoragická anémie

+ Megaloblastové anémie

+ Sideropenická anémie

+ Anémie chronických renálních chorob

+ Anémie chronických chorob

+ Hemolytické anémie

+ Ostatní anémie

+ Stromální reakce a záněty v kostní dřeni

+ Reaktivní lymfocytóza, benigní lymfocytární agregáty

+ Reaktivní plazmocytóza

+ Granulomy

+ Hemofagocytární syndrom

+ Střádací choroby (tezaurismózy)

+ Gaucherova choroba

+ Nieman-Pickova choroba

+ Nádorová onemocnění kostní dřeně

+ Myelodysplastický syndrom (MDS)

+ Refrakterní cytopenie s unilineární dysplazií (RCUD)

+ Refrakterní anémie s prstenčitými sideroblasty (RARS)

+ Refrakterní cytopenie s multilineární dysplazií (RCMD)

+ Refrakterní anémie s excesem blastů (RAEB)

+ MDS asociovaný s izolovanou delecí 5q (5q-syndrom)

+ Myelodysplastický syndrom neklasifikovatelný (MDS NOS)

+ Myeloproliferativní neoplazie (MPN)

+ Polycythaemia vera (PV)

+ Esenciální trombocytémie (ET)

+ Primární myelofibróza (PMF)

+ Chronická myeloidní leukémie (CML)

+ Chronická neutrofilní leukémie (CNL)

+ Chronická eozinofilní leukémie (CEL)

+ Mastocytóza

+ Myeloproliferativní neplazie neklasifikovatelná (MPN-U)

+ Myelodysplasticko-myeloproliferativní onemocnění (MDS/MPD)

+ Chronická myelomonocytární leukémie (CMML)

+ Atypická chronická myeloidní leukémie (aCML)

+ Juvenilní myelomonocytární leukémie (JMML)

+ Myelodysplasticko-myeloproliferativní neoplazie neklasifikovatelná

+ Akutní myeloidní leukémie (AML)

+ Lymfoproliferativní onemocnění

+ Akutní lymfoblastická leukémie (ALL)

+ Chronická lymfocytární leukémie (CLL)

+ Prolymfocytární leukémie (PLL)

+ Vlasatobuněčná leukémie (hairy cell leukaemia, HCL)

+ Plazmocelulární neoplazie

+ Plazmocelulární (mnohočetný) myelom

+ Solitární plazmocytom

+ Monoklonální gamapatie nejasného významu (MGUS)

+ Ostatní lymfoproliferace

+ Histiocytózy

+ Histiocytosis X

+ Letterer-Siweho histiocytóza

+ Hand-Schüller-Christianova histiocytóza

+ Eosinofilní granulom

+ Histiocytární sarkom

+ Metastatické postižení kostní dřeně

+ Post-teraupetické a post-transplantační změny hematopoézy

+ Post-teraupetické změny hematopoézy

+ Restituce hematopoézy

+ Perzistující změny hematopoézy

+ Posttransplantační změny hematopoézy

+ Patologie kosti

+ Ostatní poruchy

Hardware

Pro přípravu obrazů byl použit mikroskop Leica DMLB vybavený sadou objektivů HC Fluotar (HC Fluotar 5/0.15, 10/0.30, 20/0.50, 40/0.70, 100/1.30 a Plan 2/0.1). Mikroskop byl vybaven skanovací kamerou Leica S1, umožňující získat obrazy o rozlišení až 5112×5112 obrazových bodů, v 3×12 barvě.

Později jsme používali mikroskop Leica DMLA se sadou planapochromatických objektivů (HC Fluotar 5/0.15, HC PlanApo 10/0.30, 20/0.50, 40/0.70, 100/1.30 and a Plan 2/0.07) a digitální kamerou Nikon DMX 1200. Motorizovaný stolek Merzhäuser byl používán pro posun preparátu. Kamera snímla jednotlivé obrazy v rozlišení 1200×1000 obrazových bodů, 3× 8 bit barva. Program pro obrazovou analýzu a zpracování obrazu Lucia DI LIM (Laboratory Imaging, Praha) je použit pro tvorbu složených obrazů velkých velikostí (i přes 10000 obrazových bodů).

Stejný mikroskop i program byl použit pro tvorbu obrazů s možností zaostřování.

V poslední době používáme ke získávání obrazů o velkém rozlišení systém na bázi mikroskopu Nikon 90i se sadou objektivů 2 – 100×. Pro snímání jsou využívané objektivy CFI PlanApo 20×/0.75, CFI 40×/0.95, CFI VC 60×oil.im./1.40 a CFI VC 100×oil.im./1.40. Mikroskop je řízený softwarem NIS ELEMENTS AR LIM (Laboratory Imaging, Praha). Kamera Nikon DS-Fi1 má rozlišení 2560×1920 px, 3×8 bit. Součástí systému je motorový stolek Prior s držákem na 4 preparáty. Systém byl pořízen za podpory projektu MediGrid (CESNET) v roce 2008.

Obrazy s možností proostřování byly pořízeny na mikroskopu Nikon Eclipse 1000 (Plan Fluor optika) kamerou Basler v rozlišení 1300×1000 obrazových bodů ve více fokusovacích rovinách, vzdálených zpravidla 0.5 µm. Kamera je řízena softwarem pro obrazovou analýzu Lucia DI (Laboratory Imaging). Nověji pro snímámí fokusovacích obrazů používáme rovněž mikroskop Leica DMLB.

Kamerou Basler byla dále pořízena i část obrazů imunofluorescenčních.

Obrazy o vysokém rozlišení byly dále uloženy v jpeg formátu (JFIF ztrátová komprese) ve velikostech max. 900 obrazových bodů a integrovány do atlasu. Obrazy o vysokém rozlišení (pro lupu) mají velikost až 150000×150000 obrazových bodů.