Klinická část atlasu (zejména klinické obrazy) byla podporována Fondem rozvoje vysokých škol (Ministerstvo školství ČR, 2001, FRVS/0511/2001).
Onkologická část (zejména kožní lymfomy) vznikala ve spolupráci s Institutem pro dermatologii univerzitní nemocnice v Zurichu (odkud pochází většina případů kožních lymfomů).
Dále byla tato kapitola sponzorována Výzkumným záměrem č. 00065269705 (Ministerstvo zdravotnictví ČR), v rámci kterého byl pořízen původní automatický snímací mikroskop Leica DMLA.
Další podpora pochází z projektu MEFANET, projekt Budování vzdělávací sítě lékařských fakult ČR pro tvorbu a sdílení výukových materiálů na společné platformě (1. 1. 2009 – 31. 1. 2009), Kód: RP MŠMT C15/2009.
Dále získaly atlasy podporu z projektu
MediGrid. Z těchto prostředků
byl koncem roku 2008 pořízen nový automatický snímací mikroskop Nikon včetně kamery,
ovládacího software, antivibrační podložky a řídicích počítačů.
Výpočetní prostředky MediGrid jsou dále používány pro zpracování
nasnímaných obrazů.
Projekt MediGrid je financován grantem Akademie věd ČR
MediGrid — metody a nástroje pro využití sítě
GRID v biomedicíně
(T202090537).